Theo kết luận thanh tra, về cơ bản, chủ đầu tư đã thực hiện việc quản lý thực hiện dự án Hồ chứa nước Sông Chò 1 theo các quy định hiện hành. Mặc dù trong quá trình thực hiện dự án gặp nhiều khó khăn như: công tác đền bù, giải phóng mặt bằng, tình hình dịch bệnh COVID-19, địa chất phức tạp, nhất là 2 tuyến tuy nen, nhưng các nhà thầu, Ban Quản lý dự án, chủ đầu tư đã có nhiều cố gắng để triển khai, thực hiện dự án.

Bên cạnh những kết quả đạt được, quá trình tổ chức thực hiện dự án còn một số tồn tại, thiếu sót. Thanh tra Bộ kiến nghị Bộ trưởng Bộ Nông nghiệp và Phát triển nông thôn chỉ đạo Ban Quản lý đầu tư và xây dựng Thủy lợi 7 (Ban 7 - Chủ đầu tư Hợp phần xây dựng công trình đầu mối hồ chứa nước Sông Chò 1) tổ chức kiểm điểm, làm rõ trách nhiệm của các tập thể, cá nhân thuộc thẩm quyền quản lý của Ban 7 đối với các tồn tại, thiếu sót; nghiêm túc chấn chỉnh, rút kinh nghiệm đối với các tồn tại.

Cụ thể, thu hồi kinh phí thanh toán không đúng quy định cho các nhà thầu gồm: thu hồi 366.497.000 đồng; giảm trừ hợp đồng 7.272.088.000 đồng của nhà thầu Công ty cổ phần Sông Đà 5, gói thầu số 26; thu hồi 474.127.000 đồng; giảm trừ hợp đồng: 3.502.874.000 đồng của nhà thầu Tổng công ty Xây dựng Lũng Lô, gói thầu số 26; thu hồi 370.996.000 đồng của Liên danh Công ty cổ phần Xây dựng số 12 và Công ty cổ phần Xây dựng Lũng Lô 2, gói thầu số 22.

Ban Quản lý đầu tư và xây dựng Thủy lợi 7 phải kiểm tra, rà soát lại toàn bộ hồ sơ nghiệm thu, thanh toán, quản lý chất lượng của các gói thầu để có biện pháp khắc phục các tồn tại theo đúng quy định của pháp luật.

Cục Quản lý xây dựng công trình tiếp tục tăng cường kiểm tra, đôn đốc việc thực hiện dự án đến khi công trình thi công hoàn thiện, bàn giao cho đơn vị quản lý, vận hành; hướng dẫn, kiểm tra, đôn đốc Ban Quản lý đầu tư xây dựng Thủy lợi 7 thực hiện kết quả kiểm tra.

Kết quả kiểm tra cũng chỉ ra tồn tại, thiếu sót chính của Dự án Hồ Sông Chò 1 là chưa hoàn thành chuyển mục đích sử dụng rừng (phần phát sinh 56,64ha) và tận thu lâm sản một phần diện tích rừng thuộc khu vực lòng hồ, nên chưa thể tích nước hồ.

Trách nhiệm của những tồn tại này thuộc về nhà thầu tư vấn khảo sát thiết kế hai giai đoạn lập dự án đầu tư, lập thiết kế kỹ thuật…; Chủ đầu tư là Ban Quản lý dự án chuyên ngành của tỉnh Khánh Hòa (thực hiện chức năng chủ đầu tư Hợp phần bồi thường, hỗ trợ và tái định cư).

Nguyên nhân là phải chờ thực hiện trình tự thủ tục chuyển mục đích sử dụng rừng theo quy định của pháp luật về Lâm nghiệp. Việc không thể tích nước hồ cũng dẫn đến phải dừng lại một phần khối lượng thi công xây dựng hoàn thiện công trình như nút cống dẫn dòng, thi công hố xói tràn...

Ngoài ra điều kiện địa chất công trình phức tạp, điều kiện thi công khó khăn, dẫn đến kéo dài thời gian thi công. Do đó, dự án không thể hoàn thành như dự kiến.

Dự án Hồ chứa nước Sông Chò 1, tỉnh Khánh Hòa được xây dựng nhằm cấp nước tưới cho 4.300 ha đất canh tác; trong đó: Khu tưới huyện Khánh Vĩnh 1.800 ha, khu tưới Ninh Hòa 2.500 ha; cấp lưu lượng 2 m3/s trong các tháng mùa kiệt để điều tiết nước hạ du cho hạ lưu sông Cái Nha Trang; tạo nguồn cấp nước 152.000 m3/ngày đêm cho sinh hoạt, du lịch... kết hợp giảm nhẹ lũ hạ du, phát điện.

Dự án thực hiện 2017 và kết thúc 2013 với tổng mức đầu tư là trên 956 tỷ đồng; trong đó Hợp phần bồi thường, hỗ trợ và tái định cư là 98 tỷ đồng; Hợp phần xây dựng công trình đầu mối trên 858 tỷ đồng.