JMA đã ban bố cảnh báo đặc biệt về bão, vốn rất hiếm xảy ra ở đây, đối với hầu khắp các khu vực thuộc tỉnh Kagoshima, khuyến cáo người dân ở những vùng bị ảnh hưởng cảnh giác cao độ với thiên tai; khuyến cáo các nhà điều hành phương tiện giao thông công cộng hủy các chuyến tàu và chuyến bay.

Công ty đường sắt Kyushu (JR Kyushu) - đơn vị đã tạm dừng một phần hoạt động của tàu cao tốc shinkansen vào tối 28/8 - cho biết sẽ ngừng vận hành tất cả các dịch vụ tàu cao tốc và các dịch vụ đường sắt khác trên đảo Kyushu vào chiều 29/8. Trong khi đó, hai hãng hàng không Japan Airlines, All Nippon Airways đã hủy nhiều chuyến bay đến và đi từ các sân bay trong khu vực.

Công ty Đường sắt Đông Nhật Bản (JR West) thông báo hủy một số chuyến tàu cao tốc trên đoạn từ ga Hakata ở phía Bắc đảo Kyushu đến ga Hiroshima ở miền Tây Nhật Bản.

Theo chính quyền tỉnh Kagoshima và Miyazaki lân cận, tính đến ngày 28/8, ít nhất 9 người đã bị thương do bão Shanshan.

Ở miền Trung Nhật Bản, chính quyền thành phố Gamagori thuộc tỉnh Aichi xác nhận 3 người đã tử vong và 2 người bị thương do lở đất chôn vùi nhà của họ.

Tập đoàn Toyota Motor Corp. và các nhà sản xuất ô tô lớn khác có kế hoạch tạm dừng hoạt động tại một số nhà máy trong ngày 29/8, chủ yếu ở các khu vực chịu ảnh hưởng của bão.

JMA cảnh báo người dân tại các khu vực bị ảnh hưởng đề phòng nguy cơ gió mạnh cũng như nước biển dâng do bão và sóng lớn; sẵn sàng sơ tán trước khi tình hình trở nên nghiêm trọng hơn.

Tại Nhật Bản, JMA ban bố cảnh báo bão đặc biệt trong trường hợp ghi nhận bão cực kỳ mạnh. Năm 2022, khi bão Nanmadol áp sát đất liền Nhật Bản, cơ quan này đã phát đi một cảnh báo đặc biệt đối với tỉnh Kagoshima và đây là cảnh báo đầu tiên trên cả nước đối với một khu vực khác ngoài đảo Okinawa.