Tuy nhiên “cởi trói” không có nghĩa là buông lỏng quản lý để các “công ty ma” lợi dụng kẽ hở để mua bán hóa đơn, trốn thuế, gây thất thu ngân sách. Do đó, quản lý hậu kiểm đòi hỏi năng lực của cơ quan Nhà nước phải cao hơn, phức tạp hơn. Để hậu kiểm thực sự trở thành động lực mới cho môi trường kinh doanh, cơ quan quản lý phải có cuộc cách mạng trong tư duy, chuyển từ chờ doanh nghiệp mắc lỗi để xử phạt sang cảnh báo sớm để doanh nghiệp không mắc lỗi. Đồng thời, đầu tư vào công nghệ và dữ liệu nhằm phân tích, quản lý rủi ro một cách hiệu quả, có cơ chế thưởng – phát nghiêm minh. 

Nhìn tổng thể, Tiến sĩ Trần Quang Thắng, Viện trưởng Viện Kinh tế và quản lý TP. Hồ Chí Minh cho rằng, tháo gỡ các điểm nghẽn không thể bằng những giải pháp đơn lẻ mà cần một chiến lược tổng thể. Về pháp lý, phải quyết liệt giảm rào cản, không hình sự hóa các quan hệ kinh tế dân sự. Về tài chính, cần cải cách thị trường vốn, thúc đẩy các quỹ bảo lãnh tín dụng cho doanh nghiệp vừa và nhỏ, triển khai tín dụng xanh. 

Đặc biệt, cần có đòn bẩy thúc đẩy doanh nghiệp đầu tư vào nghiên cứu và phát triển (R&D), khuyến khích đổi mới sáng tạo thông qua việc cho phép khấu trừ thuế thu nhập doanh nghiệp. Đối với hệ sinh thái khởi nghiệp, việc mở rộng không gian pháp lý thử nghiệm (sandbox) sẽ cho phép các startup công nghệ thử nghiệm sản phẩm mới. Ngay cả với các hộ kinh doanh cá thể, việc chuyển đổi sang hóa đơn điện tử khởi tạo từ máy tính tiền và lộ trình xóa bỏ thuế khoán cũng là bước đi cần thiết.