Theo đó, thực hiện mô hình tổ chức mới theo Quyết định số 26/2015/QĐ-TTg ngày 08/7/2015 của Thủ tướng Chính phủ; Quyết định số 1618/QĐ-BTC ngày 22/8/2019 của Bộ trưởng Bộ Tài chính về việc chức năng, nhiệm vụ, quyền hạn và cơ cấu tổ chức của Kho bạc Nhà nước ở tỉnh, thành phố trực thuộc Trung ương tại thời điểm ngày 01/10/2015, Kho bạc Nhà nước Thanh Hóa đã từng bước kiện toàn sắp xếp bộ máy.

Cụ thể, tại Kho bạc Nhà nước cấp tỉnh giảm số phòng nghiệp vụ từ 09 phòng xuống còn 07 phòng; đổi tên chức danh lãnh đạo phòng; công chức thuộc phòng Hành chính - Quản trị, phòng Tổng hợp bố trí, sắp xếp sang Văn phòng Kho bạc Nhà nước tỉnh; công chức thuộc phòng Kho quỹ bố trí, sắp sang phòng Kế toán Nhà nước. Tại Kho bạc Nhà nước cấp huyện giải thể 27 Tổ Kho quỹ, công chức thuộc Tổ Kho quỹ, bố trí, sắp xếp sang tổ Kế toán Nhà nước.

Đến ngày 01/10/2017, thực hiện Đề án “Thống nhất đầu mối kiểm soát chi” theo Quyết định số 3219/QĐ-KBNN ngày 10/7/2017 của Tổng Giám đốc Kho bạc Nhà nước, Kho bạc Nhà nước Thanh Hóa đã sắp xếp lại tổ chức bộ máy, chức năng nhiệm vụ giữa 02 phòng Kiểm soát chi và Kế toán Nhà nước; xóa bỏ cấp tổ tại KBNN huyện, thị xã, thành phố trực thuộc, theo đó đã giảm được 27 Tổ Kế toán Nhà nước và 27 Tổ Tổng hợp - Hành chính tại KBNN cấp huyện. Các đơn vị Kho bạc Nhà nước cấp huyện thực hiện theo chế độ chuyên viên.

Căn cứ Quyết định số 1617/QĐ-BTC ngày 22/8/2019 của Bộ trưởng Bộ Tài chính về việc sáp nhập 15 KBNN cấp huyện vào KBNN cấp tỉnh; Quyết định số 4526/QĐ-KBNN ngày 04/9/2019 của Tổng Giám đốc Kho bạc Nhà nước quy định về nhiệm vụ, quyền hạn và cơ cấu tổ chức của Kho bạc Nhà nước ở huyện, quận, thị xã, thành phố thuộc tỉnh; Quyết định số 4525/QĐ-KBNN ngày 04/9/2019 của Tổng Giám đốc Kho bạc Nhà nước quy định nhiệm vụ, quyền hạn và cơ cấu tổ chức của các phòng và Văn phòng thuộc KBNN ở tỉnh, thành phố trực thuộc Trung ương, Kho bạc Nhà nước Thanh Hóa đã thực hiện giảm 02 phòng nghiệp vụ thuộc KBNN tỉnh (từ 07 phòng xuống còn 05 phòng); sáp nhập Kho bạc Nhà nước thành phố vào Kho bạc Nhà nước tỉnh, số Kho bạc Nhà nước các huyện, thị xã, thành phố từ 27 đơn vị xuống còn 26 đơn vị.

Hiện Kho bạc Nhà nước Thanh Hóa có 441 cán bộ, công chức và người lao động. Nhìn chung, toàn thể cán bộ, công chức luôn có ý thức xây dựng, giữ gìn khối đoàn kết, thống nhất, nỗ lực hoàn thành mọi nhiệm vụ được giao.