Các hợp tác xã hoạt động hiệu quả nhờ có quy mô phù hợp với từng loại hình sản xuất (không quá nhiều thành viên), chủ yếu hoạt động lĩnh vực chuyên ngành, có tiềm lực kinh tế, tham gia vào chương trình sản xuất công nghệ cao, an toàn; thực hiện liên kết để mở rộng sản xuất và tiêu thụ sản phẩm.

Bộ Nông nghiệp và Phát triển nông thôn đã triển khai các mô hình hợp tác xã điểm về đầu tư ứng dụng khoa học kỹ thuật, liên kết với doanh nghiệp sản xuất và tiêu thụ sản phẩm chè, cà phê, tiêu, lúa, tôm ở 7 địa phương đại diện cho các vùng, miền. Trên cơ sở đó, các địa phương xây dựng 252 mô hình hợp tác xã hoạt động hiệu quả để đánh giá, rút kinh nghiệm và nhân rộng.

Thực hiện thí điểm mô hình hợp tác xã nông nghiệp kiểu mới theo Quyết định số 445/QĐ-TTg của Thủ tướng Chính phủ phê duyệt tại Đề án “Thí điểm hoàn thiện, nhân rộng mô hình hợp tác xã kiểu mới tại vùng Đồng bằng sông Cửu Long giai đoạn 2016 - 2020”, đã lựa chọn 156 hợp tác xã và 19 tổ hợp tác tham gia thí điểm.

Để phát triển hợp tác xã trong nông nghiệp, Bộ Nông nghiệp và Phát triển nông thôn đang xây dựng Đề án Đổi mới, phát triển 15.000 hợp tác xã, liên hiệp hợp tác xã hoạt động hiệu quả đến năm 2020.

Tại thời điểm Luật hợp tác xã có hiệu lực (1/7/2013), cả nước có 13/18 liên hiệp và 7.211/10.425 HTX nông nghiệp cần phải đăng ký lại.

Đến hết năm 2016, có 11 liên hiệp và 6.724 HTX nông nghiệp đã đăng ký lại, đạt tỷ lệ 93,25%.

Để đẩy nhanh tiến độ đăng ký lại hợp tác xã theo quy định, Bộ Nông nghiệp và Phát triển nông thôn đã có nhiều văn bản chỉ đạo và ban hành “Tài liệu hướng dẫn thành lập và tổ chức lại hoạt động theo Luật Hợp tác xã đối với hợp tác xã trong lĩnh vực nông nghiệp” để các địa phương đẩy mạnh việc tổ chức lại hoạt động của các hợp tác xã theo Luật Hợp tác xã 2012.

Đến cuối năm 2016, cả nước có 21 liên hiệp và trên 10.700 hợp tác xã nông nghiệp, với gần 4 triệu thành viên hợp tác xã nông nghiệp, bình quân khoảng 367 thành viên/hợp tác xã./.