Theo thống kê ban đầu, vào khoảng 03h đến 05h sáng 29/9, do ảnh hưởng của các cơn lốc đã gây thiệt hại nặng nề về người và tài sản. Cụ thể, có 6 người chết, tại các xã: Hải Thịnh 1 người, Hải Anh 1 người, Quỹ Nhất 4 người; có 7 người bị thương, gồm 4 người ở xã Hải Thịnh, và 3 người ở xã Quỹ Nhất.

Các cơn giông lốc cũng đã gây sập, hư hỏng hàng chục nhà của nhân dân và 01 điểm trường tại xã Kim Đông bị tốc mái. Mưa bão cũng đã khiến 30 cột điện bị gãy đổ, một số đường dây điện bị đứt; Kè Hải Thịnh 3 vị trí tại K25+570 đê biển Hải Hậu bị sạt sập diện tích (20x15)m; Nhiều cây xanh bị gẫy đổ, nhiều diện tích lúa bị đổ.

Khoảng 8 giờ sáng 29/9, trên địa bàn tỉnh cũng đã xảy ra nhiều cơn dông lốc, gây thiệt hại nhiều tài sản, cây cối và hoa mầu của người dân.

Tại thôn Thượng Đông, xã Yên Khánh có khoảng 30 hộ bị ảnh hưởng; trong đó có 01 nhà bị sập đổ hoàn toàn. Ông Lại Văn Dũng, thôn Thượng Đông cho biết, thời điểm dông lốc xảy ra, cả nhà gồm 5 người đang ở trong nhà bỗng toàn bộ căn nhà bị đổ sập xuống. tốc mái, sập tường, đổ nhà do dông lốc. Ghi nhận tại hiện trường, toàn bộ căn nhà cấp 4 bị đổ sập hoàn toàn, rất may 5 thành viên trong gia đình chỉ bị xây xát nhẹ, nhưng tái sản của gia đình đã bị hỏng hết.

Tại tổ dân phố 4, xã Yên Khánh, dọc theo Quốc lộ 10 cũng bị ảnh hưởng nặng nề do dông lốc sáng 29/9, hai bên đoạn đường khoảng 200 mét cây cối đổ ngổn ngang, có nhiều nhà, cửa hàng kinh doanh bị đổ sập một phần, gây hư hỏng nhiều tài sản. Nhiều người dân chứng kiến cảnh tượng dông lốc cho biết, dông diễn biến rất nhanh, không ai kịp phản ứng gì, chỉ biết chạy vào các nhà kiên cố để tránh trú.

Ngay trong sáng cùng ngày, tỉnh Ninh Bình đã cử nhiều đoàn công tác tới các địa điểm bị thiệt hại nặng nề do mưa bão, dông lốc gây ra để chỉ đạo các lực lượng cứu nạn, cứu hộ; động viên nhân dân cùng đoàn kết, khắc phục hậu quả ban đầu.